Novedades introducidas
El sistema de clasificación APG III sigue la misma
línea que el del APG II y el APG. Las novedades introducidas con respecto a las
versiones previas están relacionadas con los recientes descubrimientos en el
árbol filogenético, ya que el sistema trata de reflejarlos. Los conocimientos
de la filogenia de las angiospermas generados durante la primera década
del siglo XXI han
determinado varios cambios en la circunscripción de muchas familias y en su
clasificación, así como también la adición de algunos órdenes nuevos, tal como
se ejemplifica y detalla a continuación.
Nuevos órdenes
En el APG III se adoptaron 14 órdenes nuevos,
además de los 45 que ya habían sido aceptados en APG II. Los órdenes nuevos
son: Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales,
Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales,
Picramniales, Trochodendrales, Vitales y Zygophyllales.
amborellales
Escalloniales
Filogenia de las angiospermas
parásitas
En APG III se ubicó filogenéticamente a la
mayoría de las angiospermas parásitas, buena parte de las cuales no se hallaban
incluidas en ningún orden en las versiones previas de APG. Debido a la
reducción o a la pérdida de muchos caracteres morfológicos taxonómicamente
discriminantes, las afinidades de muchos grupos de plantas micoheterótrofas o parásitas han permanecido sin dilucidar
durante décadas. Con el advenimiento de la sistemática molecular, se hicieron
disponibles nuevas herramientas para identificar a los parientes fotosintéticos
de las plantas micoheterótrofas. Así, los datos moleculares han sido utilizados
para inferir las relaciones filogenéticas de muchos clados con especies
micoheterótrofas. No obstante, los datos moleculares no ofrecen tampoco
una respuesta clara y definitiva a las relaciones filogenéticas de este tipo de
organismos debido a que, al no ser organismos fotosintéticos, no poseen
cloroplastos ni genes de cloroplasto amplificables (los cuales son
frecuentemente usados en estudios filogenéticos), o tales genes —cuando
existen— son altamente divergentes y las tasas de substitución de los genes
nucleares o mitocondriales son muy elevadas, lo que causa un sesgo en las
inferencias filogenéticas. Asimismo, la adquisición de muestras representativas
de muchos taxones, un factor crítico para realizar una reconstrucción
filogenética, es todavía un obstáculo para muchos grupos de micoheterótrofos
raros, tales como Corsiaceae, Triuridaceae, Epirixanthes (Polygalaceae), Cheilotheca (Ericaceae) y Thismiaceae
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